福建和台湾同属中亚热带向南亚热带过渡的季风性气候，生态条件十分相近，两地都有一批享誉国内外的旅游景点，福建的武夷山、土楼、鼓浪屿、太姥山、大金湖、妈祖祖庙等，台湾的阿里山、阳明山、日月潭、太鲁阁、北投温泉，不仅为两岸同胞共同向往，也深受海外华人同胞和外国旅游者青睐。台湾的许多人文古迹，尤其是民间神庙大多源于福建，如妈祖女神、保生大帝、开漳圣王、清水祖师、临水娘娘等都分灵于福建的祖庙，其他诸如观音、关帝、土地公等虽不原产于福建，但却是从福建二传到台湾，并按福建的习俗祭拜。这种独特的资源配置为闽台旅游合作奠定了良好的基础。

闽台两地共有血缘相通的5000多万居民，是互为目的地的巨大客源市场。台湾每年出岛旅游670多万人次，来福建的约50万人次左右。闽台同处在粤港澳和苏浙沪两大客源产出地之间，海峡旅游区形成后，闽台游客将急剧大幅增长，闽台两地市场开拓的潜力巨大。这种巨大的市场潜力是构建闽台旅游合作区的客源条件。

1987年台湾当局开放大陆探亲，开创了两岸经贸合作的先河，闽台合作也由最初的台胞回乡探亲、祭祖、观光旅游，到后来的投资、贸易往来，如今，对台经贸往来已成为福建对外经济中最为重要的一部分。福建台资占全国的比重一度高达70%，台胞来闽旅游人数占全省境外旅游的比重最高达40%。闽台之间农业、工业和科技合作逐步推进，文化旅游交流日益频繁。