为了促进闽台农业全面合作，推进海峡两岸合作与交流，福建省相继编制、出台了《海峡两岸（福建）农业合作试验区发展规划》、《关于鼓励和支持海峡两岸（福建）农业合作试验区建设的暂行规定》等，2009年省人大通过了大陆首个对台农业合作地方性法规《福建省促进闽台农业合作条例》，详细规划闽台农业合作培育重点，配套相关优惠政策，鼓励宽领域的交流与合作、实行优惠税收政策、提供有利的土地与海域政策、加大财政金融支持力度、创造便捷的通关环境以及保护台商的合法权益等。

由于台湾土地资源、经营成本和市场限制等原因，台湾农业发展受到严重制约。闽台农业合作为台湾同胞到福建再创业提供了广阔的新天地。如台湾天仁集团总裁李瑞河，1992年回祖籍地漳浦投资创建天福集团，从事茶叶经营，如今已建成在全国拥有1000多个直营销售店的现代大型企业集团，取得丰厚的回报。福建农民经过引进推广台湾良种、技术，促进增收。比如漳州香蕉、永春芦柑大面积示范推广台湾先进的栽培管理技术后，水果一级果率提高30％，成本下降二至三成，增收30％以上。20年多来，随着闽台农业交流合作不断深入，从蔬菜、花卉、特种养殖到食品加工、竹木加工，从引进推广台湾的瓜菜、水果、水产等近百个良种到推广无公害栽培、水果综合改造、保护地栽培、工厂化育苗等20多项新技术、新模式，两地的合作交流不仅给台湾投资者以丰厚的经济回报，也带动了福建农业结构调整、产业升级和农民增收，闽台农业合作已取得了互惠双赢的喜人成果。