5月27日，教育部发言人续梅在例行发布会上回应"南科大教改学生是否必须要参加高考"一事时提到"任何改革首先要坚持依法办学，要遵循国家基本的教育制度，以制度来保障学生的合法权益"。 南方科技大学校长朱清时表示不认同。（5月29日 新安晚报）

教育部回应南科大45名教改班学生须参加高考，应该说是对南科大招生可信度的一次社会检验。尽管高考有这样和那样的缺点，但高考的公平性和高校招生的低成本是高考必须存在的客观因素，其实高考的好处还不止这些，对于学生来说，高考能够磨练他们的意志，可能对他们一生的成长都有好处，对于各学校来说，高考能够提高基础教育的水平，促进各学校规范办学，不管怎么说高考制度能走到今天，并被广大的人民群众所认可，其最起码的一点那就是，能做到在分数面前人人平等，就这一条普通老百姓就认可。

由于普通高考具有相当的权威性，所以各大学都希望根据高考分数录取学生。尽管现在一些名校有自主招生的权力，但各学校自主招生的比例控制得还是比较低的，大部分招生还得依赖普通高考，按教育部规定，即使获得了当年高校自主招生资格的学生也必须参加高考，只是可以降一定分数录取罢了，为什么要这样，就是为了确保公平，公信。试想，如果高考不用分数说话，谁还能保证老百姓的孩子能上自己心仪的学校，谁还能阻止得了一些招生腐败现象的发生，尽管现在的高考制度有这样那样的弊病，但是只要你的孩子在高考中能考个好成绩，孩子的大学梦，名校梦就一定能实现。

当前，南方科技大学走改革创新之路令人称道，但不管怎么改，招优质生源，办公平大学的方向不能改变，教育部要求南科大45名教改班学生参加高考，不是对南科大的招生改革设置障碍，是对南科大未来发展的呵护，南科大的改革发展令世人瞩目，南科大的招生同样令社会关心，朱清时作为南方科技大学校长和知名教育家，在学校招生问题上应当谨行慎言，不应当在"南科大教改学生是否必须要参加高考"这个问题上纠结，应当考虑的是如何吸引优秀学生报考南方科技大学，学校在招生时如何为全国的考生节约考试成本，如何最大限度地保证南科大招生的公信度，只有这样，南科大的改革发展才能走得更好更远。