纪检、检察机关部分调查人员和一些学者认为，制度缺陷和监管缺位是郝鹏俊案的根源所在。

违规审批、入股办矿、挪用煤炭基金……随着煤焦领域成为山西纪检部门查处重点，因煤而生的各种腐败问题逐渐浮出水面。山西省纪委曾于2010年1月21日通报称，该省在2009年展开的煤焦领域反腐败专项斗争中，共清缴违规违纪资金145.82亿元，处理了1217名违纪党员干部。

山西财经大学法学院教授田肇树认为，制约机制不健全是“官煤”式腐败的温床。一些“一把手”的个人意志膨胀，加上他们控制着相当大的物资分配权、人事管理权和项目审批权等，腐败很容易滋生。

一位纪检部门工作人员分析说，以郝鹏俊案件为例，他自恃“一把手”，在单位大权独揽，有恃无恐，骄横跋扈。制度却不健全，配套措施不完善，执行不坚决，使制度形同虚设。

蒲县煤炭局太林煤管站站长郭敬铭说，他有时去成南岭煤矿监管提意见，局长说你不用管，这都没有问题，咱一直都是按国家规定来干的。

另一方面，对以煤焦领域为代表的基层官员监管缺位、监督无力，被认为是小官员、大腐败的重要因素。

一位办案人员认为，郝鹏俊在长期违纪违法过程中，群众的反映举报很多，但却得不到及时查处，究其原因是郝鹏俊与某些领导有着千丝万缕的联系，出了问题会有各方面的人出面说情，甚至干扰调查，对案件侦查设置障碍。在这些“背景”的庇护下，郝鹏俊可以有恃无恐地干违法犯罪的事。