两岸隔不断的妈祖文化情缘，使妈祖文化成为促进两岸交流交往的宝贵资源，发挥着其它民间交流不可替代的作用。两岸有识人士建议，多管齐下打好妈祖文化品牌，可从五个方面进一步推动妈祖文化交流，增强两岸的同根认识。

第一、国家设立“妈祖文化交流专项基金”。 采取“政府支持，民间运作”的方式与机制，专项用于占台湾宫庙总数4/5、经济基础差、宫庙财力有限、尚未到过大陆的中小宫庙信众前来湄洲朝拜参访，以进一步加深台湾基层民众对大陆的了解。

第二、开通湄洲直达台中的定期或不定期客轮直航。记者从湄洲妈祖祖庙董事会了解到，每年从台湾抵达湄洲岛的妈祖信众都超过10万人次，妈祖信众从台湾来到大陆都要费一番周折。目前，闽台海上客轮直航只有厦门、平潭等地，从台湾抵达湄洲岛的妈祖信众，都要首先抵达厦门或平潭后包车到湄洲岛。

第三、为部分热心推动两岸交流的民间人士办理往返台湾的通行证。莆田贤良港天后祖祠董事会董事长林自弟说，“现在大陆办赴台湾的手续十分麻烦，一般在一个月左右。如果没有凑够人数，可能时间会更长，这样就错过了很多交流的机会。”林自弟等妈祖宫庙的负责人建议，福建可先行先试，选择少部分热心于两岸文化交流的基层人士，为他们办理多次往返台湾的通行证，更有效地推动两岸之间的交流。

第四、加强中华妈祖网站的建设。 “中华妈祖网”的目标定位是将其打造成所有妈祖网站中最专业、最权威的网站，成为对外宣传特别是对台宣传的重要窗口。如今“中华妈祖网”总编辑部已成立，并计划在台湾北港朝天宫、鹿港天后宫、台南大天后宫、大甲镇澜宫设立编辑部。林国良建议支持该网站建设，此外可以派出通讯员，驻扎台湾各大宫庙进行日常的采访通联，也可发展台湾方面的通讯员，两岸合作共同搞好网站建设。

第五、设立一个全省性乃至全国性的学术机构中华妈祖文化研究院，与台湾合作，共同保护世遗“妈祖信俗”，挖掘妈祖文化资源，开展妈祖文化学术交流。李辉龙说，莆田将依托世界妈祖文化中心的优势，把中华妈祖文化研究院打造成为全国乃至全球妈祖文化研究方面有重要影响力的学术机构。希望在研究院机构设置和人员编制上给予政策倾斜。