1969年5月末的一天，上海市的几个造反派来到了干校，把正在劳动改造的王乃恩叫到屋里，宣布他无罪，立即解放。

原来，党的九大虽然是在极左思潮和个人崇拜的狂热气氛下召开的，但是，毛泽东依然怀念昔日的战友，特别是中共一大代表中的那几位为革命事业献身的同志。毛泽东在开幕式的讲话中再次提到了山东的王尽美，讲到了王尽美对中国革命的贡献。毛泽东的讲话确实改变了王乃恩一家人的命运，在京的造反派急忙把最高指示电传给上海的造反派。上海的造反派头头们有点慌了，毛主席在九大讲话中都提到了王尽美，可是他的儿子还在劳动改造，这怎么交待呢？于是抓紧落实毛主席指示，急急忙忙派人宣布王乃恩解放。

王乃恩得知真相后，思绪万千。他从心里感激毛主席，是他老人家在这动乱中救出了自己。2001年的秋天，我们在上海王乃恩家里采访他，当他谈到是毛泽东主席救了他时，激动得泪流满面。

王乃恩被解放后，安排到上海市静安区调查组工作，着手整顿混乱的革委会。在当时造反派一手遮天的情况下，他不为权势左右，坚持实事求是的原则，不冤枉一个好人，也不放过一个坏人。王乃恩组织力量深入调查，在掌握大量确凿事实后，硬是顶着巨大的压力，对王洪文、张春桥手下把持着静安区革委会的一个干将进行审查、批判，开除出革委会，发配小三线监督改造。与此同时，王乃恩以秘书长的身份协助静安区委筹备党代会，并拟在会后留静安区委任领导工作。由于此事处理结果完全违背了王、张等人的意愿，王洪文下令、马天水操办，不顾还有两天就要召开党代会，宣布把王乃恩立刻调离，送到离市区很远的一个大型工厂劳动改造。其实，王乃恩对这一结果早有预料，只是绝不为了个人利益玷污了党的事业。

林彪反党集团被粉碎后，毛泽东在周恩来的协助下，在全国开展批林整风运动，揭发批判林彪集团的罪行。竭力稳定党和国家的周恩来总理又把批判林彪反党集团罪行同批判极左思潮结合起来，鼓励各级干部抓生产，抓业务。在这种形势下，王乃恩才从工厂调出，分配到川沙县工作，担任县革委会副主任，分管工、青、妇、文教和农业。

在川沙县，混进县常委的几个造反派分子，竭力想控制住管理干部和党员的组织组，千方百计想把他们的小兄弟拉进组织组。然而要进这个组，必须经过分管党群的革委会副主任王乃恩同意。王乃恩严把进人关，决不允许一个造反派分子混入。于是，造反派们对他软硬兼施，当面甜言蜜语、阿谀奉承，王乃恩不为所诱，秉公办事；背地里，他们耍阴谋，放暗箭，狂妄地打击报复，王乃恩仍不动声色，坚持斗争。在那乌烟瘴气的动乱年代，王乃恩用自己坚强的党性为川沙县人民保住了一片晴朗的天。

1976年10月，金秋的风吹散了满天乌云，“四人帮”反党集团终于被拉上了历史的审判台，长达十年之久的动乱结束了。